La Escuela de F. P. Náutico-Pesquera “Ntra. Sra. de la Antigua”, surge de la idea de unos cuantos jóvenes del pueblo y el entonces Rector Don Pedro Aracama. Fue un acuerdo entre el Ayuntamiento, Asociación de Armadores de Altura y la Cofradía de Pescadores. Inicialmente, se ubicó en los locales del antiguo “Café Español”. En 1.949 es cuando empieza a funcionar la nueva Escuela.
Los primeros titulados se examinaban en la Comandancia de San Sebastián. Posteriormente, pasaron a la Comandancia de Bilbao (1.950-51).
El año 1.952 salieron los primeros Patrones de Altura que se examinaban en la “Escuela Media de Pesca” de Pasaia.
En 1.954 empieza a funcionar oficialmente la Escuela Profesional, pero siempre bajo la supervisión de la de Pasaia.
El año 1.959, El Obispado de Bizkaia creó una nueva Escuela, y allí pasó la actual Escuela de F.P. Náutico-Pesquera “Ntra Sra. de la Antigua” de Ondárroa.
En 1.998, tras la Ordenación de la Nueva Ley, se comenzaron a impartir los Grados Medios y Superiores.