El desarrollo del plan de Pastoral en cada centro pretende fomentar la participación de los centros en las diferentes actividades pastorales de Diócesis, ofrecer a los profesionales de colegios e ikastolas espacios de reflexión sobre la identidad oportunidades y para el crecimiento en la fe, promover proyectos educativos y dinámicas escolares coherentes con el mensaje de Jesús, fomentar la solidaridad con los más desfavorecidos y conectar a la familia, la escuela y la comunidad cristina.
Para ello, los centros ponen en marcha algunas iniciativas, como los proyectos de Aprendizaje y Servicio y las acciones solidarias en colaboración con entidades sociales como Cáritas o Bizitegi. También se han puesto en marcha otras actividades novedosas, como el proyecto Esnatu, un espacio de reflexión para las familias con el que podrán compartir experiencias en torno a la fe. Además, el Obispo de Bilbao, Monseñor Iceta, ya ha iniciado una visita pastoral por los diferentes centros diocesanos para conocer sus inquietudes.